CellPathfinder, High-Content-Analyse-Software

Die intuitive, benutzerfreundliche Oberfläche führt den Nutzer durch den Prozess, einschließlich der einfachen graphischen Darstellung von Bilddaten. Durch die Machine-Learning-Funktion von Yokogawa wird die Target-Erkennungsfähigkeit erheblich gesteigert. Es analysiert und digitalisiert komplexe, hochgradig schwierige High-Content-Imaging-Versuchsdaten, wie z. B. von 3D-Kultur-Systemen und Live Cell Imaging, unter Verwendung mehrerer Evaluationssysteme. Die CellPathfinder-Software ist ein leistungsstarkes Werkzeug für die HCA.

Es besteht die Möglichkeit, eine Testversion der Software herunterzuladen. Software-Download

CallPathfinder löst Schwierigkeiten

Für Screening

CellPathfinder hilft bei Screening-Engpässen.

  • Eine spezialisierte Oberfläche für die Inspektion mehrerer Stichproben gestaltet den Bildvergleich einfach und verbessert so die Effizienz.
  • Eine erweiterte Analyse unter Verwendung von KI wird durch die einfache Bedienung ermöglicht, selbst für Anfänger.
  • Verschiedene Grafikerstellungsfunktionen und einfache Bild- und Videoerzeugung machen das Reporting wesentlich einfacher.

Für die Krebsforschung und Screenings in der Regenerationsmedizin

CellPathfinder bietet führende HCA durch urheberrechtlich geschützte Analyse-Technologie.

  • Die label-free Analyse von Stichproben, bei denen Sie keine Labels wünschen, ist durch die Verwendung der urheberrechtlich geschützten Bilderzeugungstechnologie von Yokogawa möglich „CE Bright Field“.
  • Die neu entwickelte, benutzerfreundliche Machine-Learning-Funktion (Standardfunktion) macht die bisher schwierige Erkennung von diversen Phänomenen einfach.
  • Erkennung seltener Ereignisse (CTC etc.) mit hoher Geschwindigkeit und hoher Genauigkeit

 

Anwendungen

Applications

Einfacher Arbeitsablauf von Bildern zur Analyse und Grafiken

1. Stellen Sie Bilddaten dar.

Einfacher Vergleich von Bildern zwischen einzelnen Wells

 

2. Analyseprotokoll laden und ausführen

Leicht verständliche graphische Symbole
Wählen Sie eine vordefinierte Schablone für Ihre Analyse.

 

3. Einschränkung

Spezifische Populationen können durch die Gating-Funktion der Merkmale erkannter Objekte extrahiert werden.
Die extrahierten Populationen können weiter analysiert werden.

 

4. Erstellen Sie die Grafiken.

・Verschiedene graphische Optionen zur Visualisierung der Ergebnisse
・Die Verknüpfung zwischen den Graphen und den Bildern ermöglicht eine schnelle Sichtprüfung von Bildern durch Anklicken von Datenpunkten.

 

5. Für die Untersuchung weiterer Einzelheiten…listen Sie die Profile relevanter Zellen auf.

・Bilder und numerische Daten können durch das Anklicken von Zellen erfasst werden.

Yokogawa-Technologie

Maschinelles Lernen

Die Machine-Learning-Funktion ermöglicht die wertfreie Digitalisierung in Experimenten, die anhand des Erscheinungsbildes ausgewertet werden.
Die automatische Formerkennung kann durch das einfache Anklicken der Form, welche die Software lernen soll, durchgeführt werden.

Machine-learning

 

CE Bright Field (Contrast-Enhanced Bright Field)

Durch die Verwendung von Yokogawas urheberrechtlich geschützter CE-Bright-Field-Technologie, können zwei Arten von Bright-Field-Bildern erzeugt werden. Bei der ersten Art handelt es sich um Phasendifferenz-Bilder, die von einem regulären DPC (Digitaler Phasenkontrast)-Bild erzeugt werden und in der Zytoplasma-Erkennung eingesetzt werden. Bei der zweiten Art handelt es sich um Bilder mit einem Fluoreszenzbild-Charakter, die bei der Nukleus-Erkennung vorteilhaft sind.

CE Bright Field

Ergiebige Analysefunktionen

3D-Analyse

・Analyse von Z-Stapel-Bildern in 3D. ・Das Volumen und die Lage im 3D-Raum können quantifiziert werden.

3D analysis

 

Label-free Analyse

Die Erkennung von Zellen ohne Labels ist nun dank der CE-Bright-Field-Technologie möglich.
Zeit, Kosten und die Beeinflussung von Zellen infolge von Fluoreszenzmarkierung sind bei dieser Art von Phänotyp-Analyse minimal bzw. ausgeschlossen.

labelfree

 

Image-Stitching*1

Kachelbilder (Tiled images) werden durch Image-Stitching erzeugt und analysiert, wodurch genauere Quantifizierungen ermöglicht werden.
Ideal für bereichsübergreifende Analysen, wie z. B. die Analyse von Sphäroiden, Gewebeproben und Neuriten.

Tiling

 

Manuelle Definition der Region*1

Die manuelle Definition von Regionen bei komplexeren Analysen bringt einen enormen Mehrwert bei Anwendungen, bei denen die automatisierte Bildverarbeitung mangelhaft bzw. gar nicht funktioniert.
Die Morphologie in den definierten Regionen kann visualisiert werden, wodurch die Analyse noch einfacher werden kann.

Manual Region definition
Von Dr. Yasuhito Shimada, Mie University Graduate School of Medicine, bereitgestellte Daten

 

*1: Bald verfügbar

Komplettlösung - vom Imaging bis zur Analyse -

Bietet Komplettlösungen an, von der Messung bis zum robotergestützten Transport der Analyse-Platte, Messung mittels CellVoyager oder CQ1, Datenmanagement mittels CellLibrarian und Imageanalyse mittels CellPathfinder. Wir bieten optimale Kombinationen, die auf die Bedürfnisse und Mittel des Benutzers abgestimmt sind.

System

Großbild: Anklicken

Zugehörige Produkte

  • Ultimatives HCA-System für qualitativ hochwertiges Imaging and High-Throughput-Screening mit Wasserimmersionsobjektiven und mehreren Kameras
  • Eingebauter Pipettier-Roboter für kinetische Assays
  • Konfokales System in Benchtop-Größe
  • Einfache Bedienung und automatisierte Bilderfassung vieler Stichproben
  • Live-Cell-Imaging
CellLibrarian
  • Management von mit CellVoyager und CQ1 erfassten Bilddaten
  • Unternehmensmitglieder und Kooperationspartner können auf ihre Bilddaten zugreifen, sie visualisieren oder anderen zugänglich machen.
  • CellPathfinder führt Datenanalyse in CellLibrarian durch.

※In CellVoyager CV1000 erfasste Daten werden nicht unterstützt.
※CellPathfinder-System enthält die Software und den Arbeitsplatz.

Systemkonfiguration

・Software
・Arbeitsplatz
・Anzeigen

Spezifikationen des Arbeitsplatzes
Modell: Dell Precision
PROZESSOR: Intel® Xeon
Speicher: 128 GB
HDD: System(C:) 4 TB Speicherung, (D:) 4 TB
OS: Windows® 10 Pro 64 bit Japanisch /Englisch

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Yokogawa Life Science

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Die offizielle Liste der sozialen Netzwerke, in denen Yokogawa vertreten ist

Liste der sozialen Netzwerk-Auftritte

Applikations-beschreibungen
Applikations-beschreibungen
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Applikations-beschreibungen
Übersicht:

The CQ1 confocal image acquisition mechanism with the distinctive CSU® unit has a function to sequentially acquire fine cell images along the Z-axis and capture information from the entire thickness of
cells which include heterogenic populations of various cell cycle stages. In addition, saved digital images can be useful for precise observation and analysis of spatial distribution of intracellular molecules.
The CQ1 capability to seamlessly analyze images and obtain data for things such as cell population statistics to individual cell morphology will provide benefits for both basic research and drug discovery
targetingM-cell cycle phase.

Applikations-beschreibungen
Übersicht:

List of Selected Publications : CV8000, CV7000, CV6000

Applikations-beschreibungen
Applikations-beschreibungen
Übersicht:

In this tutorial, we will learn how to perform cell tracking with CellPathfinder through the analysis of test images.

Übersicht:

In this tutorial, a method for analyzing ramified structure, using CellPathfinder, for the analysis of the vascular endothelial cell angiogenesis function will be explained.

Übersicht:

In this tutorial, we will learn how to perform time-lapse analysis of objects with little movement using CellPathfinder, through calcium imaging of iPS cell-derived cardiomyocytes.

Übersicht:

In this tutorial, we will observe the change in number and length of neurites due to nerve growth factor (NGF) stimulation in PC12 cells.

Übersicht:

In this tutorial, image analysis of collapsing stress fibers will be performed, and concentration-dependence curves will be drawn for quantitative evaluation.

Übersicht:

In this tutorial, we will identify the cell cycles G1-phase, G2/M-phase, etc. using the intranuclear DNA content.

Übersicht:

In this tutorial, spheroid diameter and cell (nuclei) count within the spheroid will be analyzed.

Übersicht:

In this tutorial, a method for analyzing ramified structure, using CellPathfinder, for the analysis of the vascular endothelial cell angiogenesis function will be explained.

Übersicht:

In this tutorial, using images of zebrafish whose blood vessels are labeled with EGFP, tiling of the images and recognition of blood vessels within an arbitrary region will be explained.

Übersicht:

We have been developing a prototype of a genomic drug test support system using our CSU confocal scanner. This system administers chemical compounds that serve as potential drug candidates into living cells, which are the most basic components of all living organisms, records the changes in the amount and localization of target molecules inside cells with the CSU confocal scanner and a highly sensitive CCD camera, and processes and quantifies the captured high-resolution image data.

Technische Berichte
18.6 MB

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